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31326 Castanet Tolosan cedex - France

Dernière mise à jour : Mai 2018

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Nanopore Day 2019 - Bordeaux

 

Nanopore Day 2019

Lunid 18 mars 2019 Domaine du Haut-Carré - Talence

lundi 18 mars 2019

09:00 - 09:30 : Registration and welcome coffee

09:30 - 09:45 : Introduction

Olivier Lucas - Oxford Nanopore Technologies Ltd

Olivier Lepais & Laurence Delhaes - PGTB

09:45 - 10:30 : Nanopore Sequencing: from basics to the latest updates

Connie O'Donnell - Oxford Nanopore Technologies Ltd

10:30 - 10:50 : Genomics from roadkill: hybrid assembly with MiniON long reads improves mammalian genome assemblies

Frédéric Delsuc - Université de Montpellier

10:50 - 11:10 : From bacteria to plants: a roadtrip to Genome

François Sabot - IRD Montpellier

11:10 - 11:30 : Contribution of structural variations to the genetic and phenotypic diversity in yeast

Gilles Fisher - UMPC Paris

11:30 - 11:50 : Coming soon

Richard Bonnet - CHU de Clermont-Ferrand

11:50 - 12:10 : Quantitative analysis of HIV-1 transcriptional repertoire by Oxford Nanopore sequencing

Sarah Gallois-Montbrun - INSERM, Institut Cochin

12:10 - 12:18 : Quantitative metagenomic, new perspectives using long reads ***lightning talk***

Mathieu Almeida - INRA Jouy en Josas

12:18 - 13:20 : Lunch, Demos and poster viewing

Salle Badiane et cloître

13:20 - 14:05 : Plenary session: Unraveling human genetic diseases with nanopore sequencing

Wigard Kloosterman - University Medical Centre, Utrecht

14:05 - 14:25 : Single cell isoforms sequencing

Kévin Lebrigand - CNRS, IPMC Nice

14:25 - 14:45 : Chromosome-Scale Assemblies of Plant Genomes using Nanopore Long Reads and Optical Maps

Jean-Marc Aury - Genoscope

14:45 - 15:10 : Coffee break and poster viewing

Salle Badiane et cloître

15:10 - 15:30 : Bisulfite-independent DNA methylation landscapes of human cells

Hector Vargas - Centre Léon Bérard, Lyon

15:30 - 15:50 : Human gut microbiome analysis with nanopore technology, based on full-lengh 16S rDNA gene sequencing with GridIon

Sophie Cambos - CHU Bordeaux

15:50 - 16:10 : Dream Team : PromethION + HiC

Céline Lopez-Roques - GeT-PlaGe

16:10 - 16:45 : Kits, protocols and getting started

Angelica Vittori - Oxford Nanopore Technologies Ltd

16:45 - 17:20 : Bioinformatics developments and road-map

Stephen Rudd - Oxford Nanopore Technologies Ltd

17:20 - 17:30 : Poster awards and closing remarks

Olivier LUCAS - Oxford Nanopore Technologies Ltd

Olivier LEPAIS & Laurence DELHAES - PGTB

17:30 - 18:30 : Wine tasting, canapés and product display

Salle Badiane